新宿区立牛込第三中学校では、新宿区採択の教科書のほか、以下のような問題集を使用しています。

数学は、東京書籍が「新しい数学」に準拠して出している「基礎からの問題集」です。内容はオーソドックスで良書。次に英語もニューホライズンの版元である東京書籍が出している「イープラス」が使用教材（正直、通信教育や市販の教材よりも。いい内容だと思います）。ただし、国語で利用している「楽しく学べる文法ノート」（新学社）は、必ずしも（私見ですが）わかりやすいとは言えない。と、こういったところです。